Savjeti za otkrivanje COVID-19

Kako bi podržali otkrivanje novog koronavirusa (COVID-19) i istraživanje i razvoj cjepiva, američki Centri za kontrolu i prevenciju bolesti (CDC) i kineska vlada dovršili su sekvenciranje novog genoma koronavirusa i rezultate predali američkom NCBI GenBank ® baza podataka]. Nedavno je IDT primio upite istraživača širom svijeta o novom kompletu za otkrivanje koronavirusa. Slijedi kratak opis.

Američki centri za kontrolu i prevenciju bolesti

Američki centri za test i prevenciju bolesti * Ciljno usmjerava različita mjesta na protein COVID-19 nukleokapsidnog proteina (N-gena). Tri seta primera / sonde u ovom kompletu moraju se izvoditi istodobno s unutarnjom kontrolom koja cilja ljudski gen RNase P. Za svaki uzorak bolesnika potrebno je ukupno 4 qPCR testova.

1. Kit za otkrivanje koristi jednosatnu qPCR reakciju (to jest, reverzna transkripcija i slijedeće qPCR reakcije su završene u istom koraku);

2. Svi 3 N-genski testovi mogu se smatrati pozitivnim rezultatom samo kad Cq 0010010 lt; 35;

3. Ključna je reakcija interne kontrole RNase P. {{1 cq}} gt; 3 5 znači da ekstrakcija uzorka nije dobra i eksperiment treba ponoviti;

Molimo pogledajte najnovije američke centre za kontrolu i prevenciju bolesti COVID-19 RT-PCR metodički vodič za laboratorijske upute za relevantne dokumente i eksperimentalne protokole.

Usporedba s ostalim testnim setovima

Svjetska zdravstvena organizacija (WHO)

Eksperimentalni program Svjetske zdravstvene organizacije razlikuje se od eksperimentalnog programa američkih centara za kontrolu i prevenciju bolesti. Svjetska zdravstvena organizacija preporučuje tri reakcije qPCR-a da potvrde je li COVID-19 zaražen. Iako je ovo čitav niz eksperimentalnih protokola, ne postoji američka metoda ispitivanja CDC-a brža jer zahtijeva tri uzastopna ispitivanja i prije sljedećeg ispitivanja mora se primijetiti pozitivan rezultat. Eksperimentalni protokol testira se sljedećim redoslijedom:

1. Koronavirusni E-gen

2. RdRP gen: ciljanje SARS koronavirusa i ostalih koronavirusa povezanih sa šišmišom

3. RdRP gen: ciljanje COVID-19

Kineski centar za kontrolu i prevenciju bolesti

Komplet za otkrivanje Kineskog centra za kontrolu i prevenciju bolesti preporučuje upotrebu 2 setova prajmera / sondi. Grupa 1 cilja ORF 1 ab, a grupa 2 koristi se za potvrdu N-gena COVID-19.

Kontrolna skupina

Preliminarna analiza elektroničke simulacije pokazuje da je kombinacija IDT uzorka pozitivnog kontrolnog gena N i gena za ispitivanje CDC-a u SAD-u slična upotrebi kompleta temeljnih / probirnih vrsta kineskog CDC-a, Ministarstva zdravlja Tajlanda i HKU-a. Dobiveni rezultati eksperimentom su konzistentni. To se, naravno, temelji na elektroničkom istraživanju simulacije, pa se preporučuje korisnicima da potvrde odabrani komplet u vlastitom laboratoriju.

Za više informacija posjetite www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents